MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_74

Total Repeats: 1542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009790	CAGA	2	8	54	61	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009790	CGT	2	6	96	101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009790	CGT	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009790	CCT	2	6	294	299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009790	AAT	2	6	303	308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009790	A	6	6	356	361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009790	CAC	2	6	366	371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009790	A	6	6	376	381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009790	GCC	2	6	528	533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009790	ACT	2	6	586	591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009790	CATT	2	8	598	605	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009790	CCTGT	2	10	628	637	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009790	GACA	2	8	639	646	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009790	GCG	2	6	668	673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009790	ACA	2	6	699	704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009790	ACC	2	6	715	720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_009790	CCCT	2	8	761	768	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_009790	GCCCC	2	10	784	793	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
19	NC_009790	TGT	2	6	833	838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009790	CAT	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009790	CTGG	2	8	868	875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009790	TCG	2	6	952	957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009790	CGG	2	6	1073	1078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009790	GCC	2	6	1111	1116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009790	T	6	6	1233	1238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009790	TCA	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009790	T	6	6	1276	1281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009790	C	7	7	1287	1293	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_009790	TCAG	2	8	1319	1326	25 %	25 %	25 %	25 %	157149552
30	NC_009790	TTC	2	6	1362	1367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149552
31	NC_009790	CGG	2	6	1398	1403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149552
32	NC_009790	GCC	2	6	1415	1420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149552
33	NC_009790	ATCC	2	8	1505	1512	25 %	25 %	0 %	50 %	157149552
34	NC_009790	TC	3	6	1540	1545	0 %	50 %	0 %	50 %	157149552
35	NC_009790	CA	3	6	1546	1551	50 %	0 %	0 %	50 %	157149552
36	NC_009790	A	6	6	1589	1594	100 %	0 %	0 %	0 %	157149552
37	NC_009790	CTC	2	6	1702	1707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149552
38	NC_009790	TGG	2	6	1739	1744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149552
39	NC_009790	CTT	2	6	1745	1750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149552
40	NC_009790	TCT	2	6	1795	1800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149552
41	NC_009790	CCG	2	6	1827	1832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149552
42	NC_009790	CGT	2	6	1865	1870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149552
43	NC_009790	CTG	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009790	TG	3	6	1967	1972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009790	GCC	2	6	2036	2041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_009790	AAATC	2	10	2058	2067	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009790	CT	4	8	2068	2075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009790	GCCC	2	8	2083	2090	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_009790	T	6	6	2099	2104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009790	TA	3	6	2133	2138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009790	A	7	7	2154	2160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009790	GCA	2	6	2184	2189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149551
53	NC_009790	TAA	2	6	2223	2228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149551
54	NC_009790	TATC	2	8	2242	2249	25 %	50 %	0 %	25 %	157149551
55	NC_009790	CAAA	2	8	2250	2257	75 %	0 %	0 %	25 %	157149551
56	NC_009790	TGA	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149551
57	NC_009790	AAG	2	6	2455	2460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149551
58	NC_009790	ACT	2	6	2507	2512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149551
59	NC_009790	CAT	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149551
60	NC_009790	TGA	2	6	2553	2558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149551
61	NC_009790	TGA	2	6	2604	2609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149551
62	NC_009790	AC	3	6	2649	2654	50 %	0 %	0 %	50 %	157149551
63	NC_009790	GAGGG	2	10	2719	2728	20 %	0 %	80 %	0 %	157149551
64	NC_009790	CCT	2	6	2832	2837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149551
65	NC_009790	GAT	2	6	2872	2877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149551
66	NC_009790	GAC	3	9	2917	2925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149551
67	NC_009790	TTG	2	6	2933	2938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149551
68	NC_009790	GCA	2	6	3037	3042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149551
69	NC_009790	AGTG	2	8	3108	3115	25 %	25 %	50 %	0 %	157149551
70	NC_009790	TGT	2	6	3117	3122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149551
71	NC_009790	GGCT	2	8	3123	3130	0 %	25 %	50 %	25 %	157149551
72	NC_009790	GCA	2	6	3135	3140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149551
73	NC_009790	ATA	2	6	3260	3265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149551
74	NC_009790	ATT	2	6	3273	3278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149551
75	NC_009790	TTAC	2	8	3323	3330	25 %	50 %	0 %	25 %	157149551
76	NC_009790	ATAA	2	8	3342	3349	75 %	25 %	0 %	0 %	157149551
77	NC_009790	TAT	2	6	3409	3414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009790	AATTT	2	10	3425	3434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009790	AT	3	6	3447	3452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009790	GTCTG	2	10	3481	3490	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009790	TCC	2	6	3493	3498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_009790	AAT	2	6	3510	3515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149560
83	NC_009790	CAT	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149560
84	NC_009790	GAA	2	6	3589	3594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149560
85	NC_009790	GTA	2	6	3650	3655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149560
86	NC_009790	TGCC	2	8	3726	3733	0 %	25 %	25 %	50 %	157149560
87	NC_009790	A	7	7	3804	3810	100 %	0 %	0 %	0 %	157149560
88	NC_009790	CGG	2	6	3817	3822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149560
89	NC_009790	TG	3	6	3883	3888	0 %	50 %	50 %	0 %	157149560
90	NC_009790	CTG	2	6	3964	3969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149560
91	NC_009790	A	6	6	3978	3983	100 %	0 %	0 %	0 %	157149560
92	NC_009790	GCCGGA	2	12	4014	4025	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157149560
93	NC_009790	TAA	2	6	4026	4031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149560
94	NC_009790	TGT	2	6	4087	4092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149560
95	NC_009790	GCCG	2	8	4104	4111	0 %	0 %	50 %	50 %	157149560
96	NC_009790	TTA	2	6	4147	4152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149560
97	NC_009790	AGC	2	6	4180	4185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149560
98	NC_009790	TGA	2	6	4189	4194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149560
99	NC_009790	TC	3	6	4197	4202	0 %	50 %	0 %	50 %	157149541
100	NC_009790	CTGG	2	8	4220	4227	0 %	25 %	50 %	25 %	157149541
101	NC_009790	CTT	2	6	4476	4481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149541
102	NC_009790	GAACG	2	10	4510	4519	40 %	0 %	40 %	20 %	157149541
103	NC_009790	CGCC	2	8	4584	4591	0 %	0 %	25 %	75 %	157149509
104	NC_009790	GGC	2	6	4668	4673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149509
105	NC_009790	GAA	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149509
106	NC_009790	CCGG	2	8	4929	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	157149509
107	NC_009790	CCTG	2	8	4951	4958	0 %	25 %	25 %	50 %	157149509
108	NC_009790	TGG	2	6	4959	4964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149509
109	NC_009790	GATGT	2	10	4982	4991	20 %	40 %	40 %	0 %	157149509
110	NC_009790	CAG	2	6	5013	5018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149509
111	NC_009790	TGT	2	6	5145	5150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149509
112	NC_009790	CGT	2	6	5203	5208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149509
113	NC_009790	CTG	2	6	5266	5271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149509
114	NC_009790	TGA	2	6	5328	5333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149509
115	NC_009790	TGA	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149509
116	NC_009790	CGG	2	6	5435	5440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149509
117	NC_009790	CCGGA	2	10	5458	5467	20 %	0 %	40 %	40 %	157149509
118	NC_009790	ATCC	2	8	5473	5480	25 %	25 %	0 %	50 %	157149509
119	NC_009790	GGT	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149509
120	NC_009790	TGCA	2	8	5612	5619	25 %	25 %	25 %	25 %	157149509
121	NC_009790	CAC	2	6	5637	5642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149509
122	NC_009790	CAG	2	6	5702	5707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149509
123	NC_009790	GGC	2	6	5718	5723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149509
124	NC_009790	CTG	2	6	5830	5835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149509
125	NC_009790	ACA	3	9	5888	5896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149509
126	NC_009790	GGT	2	6	5965	5970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149509
127	NC_009790	GCG	2	6	5977	5982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149509
128	NC_009790	GAT	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149505
129	NC_009790	TAC	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149505
130	NC_009790	CAG	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149505
131	NC_009790	TTG	2	6	6354	6359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149505
132	NC_009790	CAGC	2	8	6378	6385	25 %	0 %	25 %	50 %	157149505
133	NC_009790	GCAA	2	8	6402	6409	50 %	0 %	25 %	25 %	157149505
134	NC_009790	AGG	2	6	6414	6419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149505
135	NC_009790	CTG	2	6	6429	6434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149505
136	NC_009790	TGC	3	9	6472	6480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149505
137	NC_009790	A	7	7	6518	6524	100 %	0 %	0 %	0 %	157149505
138	NC_009790	AAG	2	6	6546	6551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149505
139	NC_009790	A	6	6	6571	6576	100 %	0 %	0 %	0 %	157149505
140	NC_009790	CGC	2	6	6700	6705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149528
141	NC_009790	GAT	2	6	6718	6723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149528
142	NC_009790	TCG	2	6	6780	6785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149528
143	NC_009790	GCT	2	6	6795	6800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149528
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145	NC_009790	CAC	2	6	6858	6863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_009790	TTC	2	6	6875	6880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009790	TGAT	2	8	6933	6940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009790	T	6	6	6959	6964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009790	CTG	2	6	7021	7026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149527
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160	NC_009790	AGCCGC	2	12	7564	7575	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
161	NC_009790	TCGA	2	8	7588	7595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_009790	A	6	6	7621	7626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009790	CAC	2	6	7628	7633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_009790	TTC	2	6	7645	7650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_009790	TGAT	2	8	7703	7710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_009790	CGG	2	6	8278	8283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149529
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181	NC_009790	TCG	2	6	8634	8639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_009790	GTGGCG	2	12	8659	8670	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	157149555
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234	NC_009790	TGGCAG	2	12	10989	11000	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157149554
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238	NC_009790	GC	3	6	11190	11195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
239	NC_009790	ATG	2	6	11209	11214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
240	NC_009790	GGT	2	6	11252	11257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_009790	ACA	2	6	11338	11343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
243	NC_009790	GAA	2	6	11378	11383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
244	NC_009790	GT	4	8	11417	11424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
245	NC_009790	GT	3	6	11430	11435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
246	NC_009790	GGC	2	6	11513	11518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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250	NC_009790	GCG	2	6	11734	11739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_009790	ATCAC	2	10	11783	11792	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
252	NC_009790	ATT	2	6	11803	11808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_009790	CAT	2	6	11817	11822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_009790	CCTT	2	8	11838	11845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
255	NC_009790	GGC	2	6	12060	12065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149543
256	NC_009790	TGG	2	6	12156	12161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149543
257	NC_009790	A	6	6	12289	12294	100 %	0 %	0 %	0 %	157149543
258	NC_009790	CTG	2	6	12303	12308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_009790	CAT	2	6	12399	12404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_009790	GCA	2	6	12428	12433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_009790	CGA	2	6	12434	12439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_009790	AG	4	8	12448	12455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
263	NC_009790	ATC	2	6	12478	12483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_009790	GTT	2	6	12515	12520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_009790	GGAA	2	8	12524	12531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
266	NC_009790	TTAC	2	8	12703	12710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
267	NC_009790	GGGC	2	8	12728	12735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
268	NC_009790	GTCT	2	8	12759	12766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
269	NC_009790	CAA	2	6	12801	12806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_009790	GAT	2	6	12915	12920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_009790	GAA	2	6	12946	12951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
272	NC_009790	CAC	2	6	12990	12995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_009790	AGG	2	6	13022	13027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
274	NC_009790	GCA	2	6	13092	13097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_009790	GCAA	2	8	13139	13146	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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278	NC_009790	GCTG	2	8	13251	13258	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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402	NC_009790	CGA	2	6	19910	19915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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408	NC_009790	CAA	2	6	20377	20382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149553
409	NC_009790	TAA	2	6	20419	20424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149553
410	NC_009790	CAGC	2	8	20449	20456	25 %	0 %	25 %	50 %	157149553
411	NC_009790	ATTC	2	8	20476	20483	25 %	50 %	0 %	25 %	157149553
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447	NC_009790	AAG	2	6	22429	22434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_009790	TAA	2	6	22495	22500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_009790	TCA	2	6	22518	22523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_009790	ATG	2	6	22524	22529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
452	NC_009790	ATC	2	6	22709	22714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_009790	ATA	2	6	22730	22735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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